История
История
Времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS, МАЛДИ-ТОФ МС) используется для рутинной идентификации микроорганизмов в лабораториях.
Дифференциация и идентификация микроорганизмов – определение родовой, видовой и типовой принадлежности является наиболее трудоемким и ответственным этапом микробиологических исследований в науке, медицине, фармацевтике, промышленном производстве (в том числе продуктов питания) и многих других областях. Несмотря на то, что существует множество различных методов идентификации микроорганизмов, в целом, современные подходы можно разделить на 2 группы: фенотипические и генотипические.
К группе фенотипических методов относятся методы, основанные на изучении фактически проявляемых свойств микроорганизма:
Однако следует признать, что проявление фенотипических признаков микроорганизма, зачастую зависит от используемых питательных сред и условий культивирования.
Генотипические методы не зависят от условий культивирования, они основаны на анализе последовательности ДНК. В качестве наиболее популярных выделяют:
Каждый из перечисленных методов имеет свои достоинства и недостатки и применяется в зависимости от поставленной цели.
В сравнении с традиционными методиками определения, MALDI-TOF MS характеризуется гораздо более высокой скоростью идентификации, точностью определения, более низкими эксплуатационными и временными расходами.
Использование стандартизированных методик MALDI-TOF MS позволяет точно идентифицировать до вида большинство клинически значимых бактерий. При применении этой технологии анализируются спектральные характеристики значительного числа белковых молекул, преимущественно рибосомальных белков, являющихся уникальным для конкретного микроорганизма. Далее масс-спектр микроорганизма клинического («неизвестного») образца сравнивается со стандартными масс-спектрами микроорганизмов из базы данных спектров.
Также надежна и рутинная идентификация дрожжей и микроскопических грибов с использованием MALDI-TOF MS.
Преимуществами метода являются высокая производительность, эффективность и низкая цена.
Ключевой момент для успешной регистрации масс-спектра – правильный выбор матрицы. Количество органических соединения, использующихся в качестве матрицы очень велико и должно отвечать следующим требованиям:
Наиболее широкое применение в качестве матриц нашли коричная кислота, 3-амино-4-гидроксибензойная кислота, никотиновая кислота, α-циано-4-гидроксикоричная кислота, 2,5-дигидроксибензойная кислота, 6,7-дигидроксикумарин, 2-(4-гидроксифенилазо)-бензойная кислота, 3-гидроксипиколиновая кислота, 2,4,6-тригидроксиацетофенон и многие другие. В качестве растворителей чаще всего используют воду, ацетон, этанол, ацетонитрил, хлороформ, тетрагидрофуран и др.
Диаэм предлагает MALDI-TOF масс-спектрометр CMI-1600 ведущего китайского производителя Hexin Instrument Co. для идентификации различных микроорганизмов, в т.ч. изолированных бактерий и микроскопических грибов.
Наименование |
Характеристики |
Автоматическая масс-спектрометрическая система идентификации микроорганизмов CMI-1600 |
|
Конфигурация лазера |
|
Длина волны, нм |
343, твердотельный лазер |
Частота, Гц |
1-2000 |
Наработка на отказ, вспышек |
более 2x1010 |
Вакуумная система |
|
Мембранный насос |
1.8 м3/ч, 1.0 мбар |
Турбомолекулярный насос |
260 л/с, 10-5 Па |
Детектор |
|
Эффективная площадь, мм |
27 |
Время отклика, нс |
1,3 |
Масс-спектрометр |
|
Масс-анализатор |
Линейный времяпролетный |
Длина трубки TOF, мм |
842,5 |
Длина полета ионов, мм |
1000 |
Диапазон масс, кДа |
0,03-199 |
Чувствительность |
500 фмоль БСА отношение сигнал/шум 50:1 |
Точность по массе, ppm |
при использовании внутреннего стандарта: менее 150 при использовании внешнего стандарта: менее 200 |
Повторяемость масс |
0,015% |
Разрешение |
Пептиды: более 2000 FWHM (m/z 1619,8) Белки: более 450 FWHM (m/z 44613) Конкретные показатели по белкам: 400 FWHM для инсулина (m/z 5,734) 600 FWHM для миоглобина M2+ (m/z 8,476) 700 FWHM для цитохрома С (m/z 12,361) 800 FWHM для миоглобина (m/z 16,952) |
База данных |
|
База данных |
397 родов, 2500 видов, 10000 штаммов |
Пропускная способность |
До 96 образцов за 12 минут |
Hexin Instrument, Китай
Масс-спектрометр времяпролетный с матричной лазерной ионизацией (MALDI-TOFMS) CMI-1600, 199 kDa |
||||||||||||
CMI-1600
|
|
для идентификации микроорганизмов
|
|
По запросу По запросу |
|
|
|
|||||
Времяпролетная масс-спектрометрия с матрично-активированной лазерной десорбцией/ионизацией (MALDI-TOF MS, МАЛДИ-ТОФ МС) используется для рутинной идентификации микроорганизмов в лабораториях. В сравнении с традиционными методиками определения, такими как ПЦР, фенотипирование, биохимические и люминесцентные методы, MALDI-TOF MS характеризуется гораздо более высокой скоростью идентификации, точностью определения, более низкими эксплуатационными и временными расходами. Характеристики масс-спектрометра CMI-1600
|
||||||||||||
|
См. также:
Счетчики клеток, анализаторы жизнеспособности
Станции выделения НК и белков, дозирования
Боксы (шкафы) биологической безопасности
С помощью личного кабинета Вы сможете:
Сравнение